Местность, на которой расположен район Щукино, заселена по крайней мере около трёх тысяч лет назад. Именно к концу третьего тысячелетия до нашей эры относятся неолитические стоянки первобытных людей, обнаруженные археологами. Вблизи речки Химки археологи открыли культурный слой древнего русского селища, датированного учеными XV веком.
Деревня Щукино впервые упоминается в грамоте московского великого князя Василия Васильевича Темного, адресованной его двоюродному брату Дмитрию Юрьевичу Шемяке. Этот документ датируется 1441-1442 годами.
На Москве-реке под деревней Щукино был брод, через который шла дорога на Острогино (теперь Строгино) и Троицкое-Лыково. Это отразилось на планировке деревни, которая протянулась под углом к берегу Москва-реки со стороны старой Волоколамской дороги, проходившей в то время по линии современных улиц Маршала Василевского и Маршала Бирюзова. В 1701 г. при деревне числился пруд с рыбой и мельница на речке Химки. Население по данным ревизской сказки 1721 г. составило 49 душ мужского пола.
На рубеже следующего, девятнадцатого столетия в Щукино насчитывалось 25 дворов и 156 жителей обоего пола. Близ деревни на речке Химке круглогодично работало две мельницы-крупчатки, Верхняя и Нижняя, о трех поставах каждая. Отдельные предприимчивые крестьяне выписывались в купеческое сословие. Среди них были Алексей Иванов с двумя сыновьями, Василий Никитин и др. Однако в Отечественную войну 1812 г. деревня была разграблена и пришла в упадок.
После отмены крепостного права поблизости от Щукина появляются первые предприятия. Московский купец второй гильдии Ефим Хрисанович Белишев устроил на речке Химки небольшую шерстопрядильную фабрику. После революции это предприятие получило название «Красная прядильня», а затем была реорганизована в завод шитых ремней (сейчас на улице Водников у Волоколамского шоссе). Другое небольшое предприятие — красильно-отбельная фабрика была основана инженером Александром Наумовичем Гранатом. Работало на этой фабрике только десять человек, а в 1908 году в результате застоя в делах она прекратила свое существование.
По обе стороны старой Волоколамской дороги в старину располагались леса — Ходынская роща и Большая Всехсвятская роща. Постепенно леса эти сводились и на их месте размещались летние лагеря войск московского гарнизона. На месте прежней Ходынской рощи стояла лагерем 1-я Гренадерская артиллерийская бригада, квартировавшая неподалеку — в Николаевских казармах на Хорошевском шоссе. А на опушке Всехсвятской рощи разместилось лагерное отделение Московского военного госпиталя для военных училищ.
Дом учёных им. А.П. Александрова.
В 1897 г. здесь построили деревянную церковь великомученика Пантелеймона-целителя. Эта небольшая церковка напоминала сруб деревенской избы. В 1902 г. к церкви был пристроен каменный придел, посвященный иконе Божией Матери «Скоропослушница». Здание храма было построено на средства благотворителя И.А. Колесникова. После революции храм закрыли, а деревянную его часть снесли. Ровно через 90 лет после основания, в 1992 г. в день праздника иконы «Скоропослушницы» церковь вновь была открыта.
Часть Всехсвятской рощи, прилегавшая к Ходынскому полю, в начале XX века застраивается дачными домами, заселявшимися в основном семьями офицеров. После открытия в 1908 году на Окружной железной дороге станции Серебряный Бор, дачный поселок получил название Всехсвятский Серебряный Бор.
В советское время в Щукино был создан колхоз «Работник». Однако хозяйственными успехами он не блистал. Зато большую славу приобрели местные пляжи.
Башни-близнецы, высотки «Аллые паруса». Апрель 2006 г.
Существенно изменился вид окрестностей Щукино и вся его жизнь в связи со строительством канала Москва-Волга. Окрестности Щукина с их сухими песчаными почвами и здоровыми климатическими условиями в 1930-х годах было решено использовать для создания огромного научного комплекса — Всесоюзного института экспериментальной медицины, под строительство которого отвели участок в 400 гектаров.
Начавшаяся Великая Отечественная война перечеркнула планы. В недостроенных корпусах ВИЭМа в 1943 году была размещена Лаборатория измерительных приборов АН СССР (Липан) — центр ядерных исследований, которыми руководил Курчатов. Рядом разместились научные центры-смежники — СНИИП, Институт № 9 НКВД. В задачи последнего входила организация исследований, направленных на обеспечение производства ядерных материалов (теперь Всероссийский НИИ неорганических материалов имени академика А. Бочвара).
В 1930 — 1940-е годы застройка прилегающих к деревне Щукино территорий была малоэтажной и состояла из небольших ведомственных поселков. В пятидесятых-шестидесятых годах прошлого века развернулось массовое жилищное строительство.
Район Щукино, как административная единица города Москвы, был образован в 1991 году из части Хорошевского (Ворошиловского) района города (по старому районированию). Район включает часть территории Октябрьского (Ходынского) поля, присоединенную к Москве в 1937 году и деревню Щукино, вошедшую в состав Москвы в 1947 г.
Щукино граничит с районами Северо-Западного административного округа: на юге с Хорошево-Мневники, на севере с Покровское-Стрешнево, на западе — со Строгино и на востоке с районом Сокол, входящим в состав Северного административного округа.
Граница района проходит по руслу реки Москва, каналу им. Москвы, Рижскому направлению Московской железной дороги, Московской окружной железной дороге и улице Берзарина.
Вид со стороны Строгино на Строгинский мост район Щукино.
В Щукине сосредоточены крупнейшие предприятия, научно — исследовательские институты, лечебные центры – заведения городского и федерального значения, имеющие мировое признание, расположены военно-дипломатическая академия, текстильный институт.
Площадь территории района составляет 900 га. Численность постоянного населения – примерно 90 тысяч человек.