Район Нагатинский затон расположен на Юге Москвы, на правом берегу реки Москвы, с трех сторон, как полуостров, окружен Москва-рекой. Граница района проходит по южным и западным границам территории музея-заповедника «Коломенское», далее по проспекту Андропова, старому руслу реки Москвы, шлюзу 10-11 реки Москва до южных границ музея-заповедника «Коломенское».
На месте, где сейчас стоят современные дома района, в древности находились подмосковные села: Коломенское, Нагатино, Новинки.
Проводившиеся археологические раскопки показали, что уже две с половиной тысячи лет назад здесь появилось первое селение первобытных людей. Были открыты древнейшие неолитические поселения людей 1 тысячелетия до н.э. — IV века н.э., давшее название всей культуре этого периода — «Дьяковская культура» (археологическая культура раннего железного века). Это одно из первопоселений людей на территории современной Москвы.
Основа хозяйства племен Дьяковской культуры — земледелие, оседлое скотоводство, рыболовство, охота. Население городищ Дьяковской культуры владело техникой обработки дерева, кости, металла, знало гончарное производство и ткачество.
О времени возникновения двух старинных подмосковных сел Коломенского и Нагатинского документов нет. Первые письменные упоминания о них встречаются в духовных грамотах 1336 и 1339гг. князя Ивана Калиты.
Название села «Нагатино», известного с XIV века, по одной из версий, связано с тем, что в этой низменной пойме Москвы-реки, затопляемой в половодье, дороги были расположены «на гати», т. е. на настиле из бревен для проезда и прохода по топи; по другой — от слова «ногата», обозначавшее древнерусскую денежную единицу X-XV вв.
Вокруг Нагатина исстари было много заливных лугов и озер, которые жители могли использовать для постройки и ремонта судов. О Нагатинской заводи упоминается в 1410 г. В Нагатине и поныне существует «заводь» (или затон) — бухта, залив со спокойной, стоячей водой.
Спасские ворота в Коломенском.
В этом затоне в 1936 году был введен в действие Московский судостроительный и судоремонтный завод. Основное направление работы завода — судостроение и ремонт самоходного флота, изготовление судовых механизмов и светосигнальной аппаратуры. Около завода был построен рабочий поселок.
Первое судно коллективом завода было построено в 1938 году. Особенно популярными на речных путях стали теплоходы типа «Москвич», так называемые речные трамвайчики. Одновременно завод строил крупные серии речных буксиров-толкачей, озерных пассажирских судов для пригородных линий и их модификации для служебных и научно-исследовательских целей.
Вид на музей-заповедник Коломенское с высоты.
Расположение завода создало предпосылки для образования профессионально-технических училищ: Московского речного техникума, Московского института водного транспорта — для подготовки специалистов речного пароходства и судостроения. В 1993 году все эти учреждения были объединены в Московскую Государственную академию водного транспорта.
В 1960 году подмосковные села: Нагатино, Коломенское, Новинки вошли в черту Москвы и в конце 1960-х годов на этой территории началась массовая жилая застройка. На месте сносимых деревянных строений, садов и огородов выросли кварталы многоэтажных домов.
На правом берегу реки Москвы, после реконструкции Нагатинской поймы и сооружения нового речного русла, в 60-х годах была построена Нагатинская набережная, выполненная из сборного железобетона, облицованного гранитом. Архитектурное решение застройки жилых корпусов со стороны реки Москвы — в виде домов, стилизованных под паруса, создает современный фасад района.
Вид со смотровой площадки в парке Коломенское на жилые дома района Нагатинский Затон. 1993 год.
В 1969 году близ Нагатино сооружен Нагатинский мост, который соединил Нагатино с районом Кожухово, здесь проспект им. Андропова, построена станция метро «Коломенская».
От древних подмосковных сел, на территории которых расположился район Нагатинский затон в настоящее время сохранились лишь их названия, которые даны улицам, набережным, мосту, станции метро: Коломенская улица, Коломенская набережная, метро «Коломенская», Нагатинская набережная, Нагатинский мост, улица Новинки. Центральная улица села Коломенское — Большая улица — сохранилась по сей день с тем же названием.
Названия остальных улиц связаны с судостроительным производством и ландшафтными особенностями района: Судостроительная улица, улица Речников, Якорная улица, Затонная улица. Название «Кленовый бульвар» дано в связи с посадкой вдоль бульвара различных видов клена. К территории района Нагатинский затон также относится крупный зеленый массив, расположенный на полуострове севернее жилых массивов района — Нагатинская пойма.
Храм Спиридона Тримифунтского в Нагатинском Затоне. Особенность храма — крест с подсветкой, сделанный специально для этого храма. Вставки из цветного стекла на кресте, оснащены светодиодами, которые светятся в темноте.
Нагатинская пойма — крупнейшая пойма в черте города. Пойма — это часть дна речной долины, затопляемая только в половодье. Средняя высота над уровнем реки 1 — 1,5 м. До сооружения в 1930-х годах Перервинского гидроузла территория затоплялась во время паводков и была сильно заболочена.
В конце 60-х годов Нагатинская пойма была полностью реконструирована. Здесь были проведены большие работы по ликвидации заболоченности, был сооружен спрямительный канал длиной 3,5 км, в результате чего образовался остров площадью свыше 150 га, разделенный Нагатинским мостом.
В 1985 году на пойме построен Южный речной вокзал (архитектор А.М.Рухлядев) — это вторые речные ворота Москвы после Северного речного вокзала. Здание вокзала выполнено из железобетонных конструкций и стекла, вытянуто вдоль берега, украшено башней со шпилем.
На территории поймы расположена ярмарка детских товаров — «Коломенская» ярмарка.
Оба слова в названии района несут смысловую нагрузку: «Нагатинский» — от названия села «Нагатино», «Затон» — бухта, залив со спокойной, стоячей водой.
Население района составляет 85,5 тыс.чел.